一般儀器設備（具體的儀器設備要根據實驗室的要求來選用）

1. 培養箱：主要用于實驗室微生物的培養，為微生物的生長提供一個適宜的環境。

1）普通培養箱：一般控制的溫度范圍為：室溫＋5～65度，又分為電熱恒溫培養箱和隔水式恒溫培養箱。

2）生化培養箱：一般控制的溫度范圍為：5～50度。

3）恒溫恒濕箱：一般控制的溫度范圍為：5～50度，控制的濕度范圍為：50～90％。可作為霉菌培養箱。

4）厭氧培養箱：適用于厭氧微生物的培養。

2. 電熱干燥箱：用于吸管，平皿類玻璃器皿的干熱、滅菌和烘烤。

3. 高壓蒸汽滅菌器（又叫高壓滅菌鍋）：物品的滅菌。

4. 冰箱：

5. 電子天平：一般要求具備精度達到萬分之一的分析天平。

6. 顯微鏡：觀察細菌形態和動力、微生物和微小物品結構的必備儀器。

7. 均質器：用于均質樣品，有旋轉刀片式和拍擊式可以選擇。

8．蒸餾水器：提供蒸餾水

9．水浴鍋：部分培養溫度需要水浴（如大腸桿菌檢驗）

10.超凈工作臺：超凈工作臺作為代替無菌室的一種設備，使用簡單方便，為實驗的開展提供一個相對無菌的操作臺。超凈工作臺灣隊根據風向分為水平式和垂直式。

其它可能用到的設備：高壓鍋、厭氧培養設備、離心機、振蕩器、烤箱、恒溫水浴箱、菌落計數器、電位 pH計、高速離心機等設備。